Protein–RNA interactions for Protein: Q64512

Ptpn13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn13Q64512 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ptpn13Q64512 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ptpn13Q64512 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ptpn13Q64512 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ptpn13Q64512 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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Ptpn13Q64512 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Ptpn13Q64512 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Ptpn13Q64512 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Ptpn13Q64512 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms