Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Top2bQ64511 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Top2bQ64511 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Top2bQ64511 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Top2bQ64511 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms