Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Clcn1Q64347 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms