Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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Trim24Q64127 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Trim24Q64127 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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