Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Zfp248Q640N4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms