Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc18Q640L5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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Ccdc18Q640L5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Ccdc18Q640L5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc18Q640L5 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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