Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Defa17Q64016 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms