Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Itga6Q61739 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Itga6Q61739 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms