Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
PcolceQ61398 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
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PcolceQ61398 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
PcolceQ61398 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
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