Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cnot7Q60809 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms