Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prdm1Q60636 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms