Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Slc5a6Q5U4D8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms