Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trim38Q5SZ99 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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