Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Trappc1Q5NCF2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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