Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
E2f8Q58FA4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms