Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnpc3Q3UZ01 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnpc3Q3UZ01 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms