Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms