Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssbp4Q3U4B1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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