Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc174Q3U155 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc174Q3U155 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms