Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnnm2Q3TWN3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnnm2Q3TWN3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms