Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Shcbp1lQ3TTP0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Shcbp1lQ3TTP0 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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