Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtf3c3Q3TMP1 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms