Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RubcnlQ3TD16 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms