Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
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Gm1123Q1RME4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm1123Q1RME4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms