Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ttc21bQ0HA38 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms