Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Kcnma1Q08460 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnma1Q08460 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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