Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sox13Q04891 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Sox13Q04891 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Sox13Q04891 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sox13Q04891 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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