Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scg2Q03517 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Scg2Q03517 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93 ms