Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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NfiaQ02780 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NfiaQ02780 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NfiaQ02780 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NfiaQ02780 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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NfiaQ02780 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NfiaQ02780 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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