Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Pax5Q02650 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Pax5Q02650 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms