Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Cacna1cQ01815 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms