Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Top2aQ01320 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Top2aQ01320 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms