Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gja5Q01231 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gja5Q01231 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms