Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
AlkP97793 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AlkP97793 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AlkP97793 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.1 ms