Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rps3aP97351 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms