Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx3P81067 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms