Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tp53bp1P70399 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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