Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp46P62069 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms