Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ube2d1P61080 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms