Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tpm2P58774 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms