Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cldn18P56857 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cldn18P56857 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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