Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Irf5P56477 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms