Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
XpcP51612 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
XpcP51612 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XpcP51612 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XpcP51612 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms