Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod1P49813 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod1P49813 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod1P49813 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Tmod1P49813 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Tmod1P49813 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Tmod1P49813 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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