Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lig1P37913 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lig1P37913 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lig1P37913 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms