Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RxrgP28705 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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