Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

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Length 283 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gjb1P28230 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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