Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm14201-201ENSMUST00000117627 289 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ChgaP26339 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ChgaP26339 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms