Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxd8P23463 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxd8P23463 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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