Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkchP23298 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkchP23298 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PrkchP23298 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
PrkchP23298 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
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